生物學(xué)和工程學(xué)是發(fā)酵工程發(fā)展的基礎(chǔ)，而生物學(xué)和工程學(xué)相關(guān)領(lǐng)域的蓬勃發(fā)展，為現(xiàn)代發(fā)酵工程的發(fā)展進(jìn)步奠定了基礎(chǔ)。未來(lái)的生物學(xué)領(lǐng)域，基于各種組學(xué)和試驗(yàn)生物科學(xué)的進(jìn)步，對(duì)細(xì)胞功能的認(rèn)識(shí)將進(jìn)一步深入，對(duì)細(xì)胞功能進(jìn)行優(yōu)化的方法將不斷豐富，效果將不斷提高，同時(shí)發(fā)酵產(chǎn)品以及相關(guān)發(fā)酵工藝將大大拓展。
　　未來(lái)工程學(xué)領(lǐng)域的研究，基于對(duì)細(xì)胞群體效應(yīng)的解析，將向著過(guò)程的系統(tǒng)與集成優(yōu)化方向發(fā)展，通過(guò)優(yōu)化模塊單元與系統(tǒng)組裝來(lái)優(yōu)化發(fā)酵過(guò)程，最終提高目標(biāo)產(chǎn)品的產(chǎn)量。未來(lái)，系統(tǒng)生物學(xué)和合成生物學(xué)技術(shù)，發(fā)酵過(guò)程的細(xì)胞群體效應(yīng)解析技術(shù)、發(fā)酵過(guò)程的復(fù)雜多相體系放大技術(shù)、基于多產(chǎn)物聯(lián)產(chǎn)目標(biāo)的全局調(diào)控技術(shù)、發(fā)酵過(guò)程集成和系統(tǒng)優(yōu)化技術(shù)等將成為未來(lái)發(fā)酵工程發(fā)展的主要技術(shù)平臺(tái)。
    產(chǎn)業(yè)方面，未來(lái)10-20年的時(shí)間，中國(guó)將逐步從發(fā)酵工業(yè)大國(guó)轉(zhuǎn)變?yōu)榘l(fā)酵工業(yè)強(qiáng)國(guó)。發(fā)酵工業(yè)產(chǎn)品將更加集中于國(guó)內(nèi)已形成較大規(guī)模，對(duì)國(guó)民經(jīng)濟(jì)產(chǎn)生重大影響的產(chǎn)品，已形成出口能力，能參與國(guó)際競(jìng)爭(zhēng)的產(chǎn)品，受知識(shí)產(chǎn)權(quán)限制，長(zhǎng)期依賴(lài)進(jìn)口，急需技術(shù)突破的產(chǎn)品。技術(shù)發(fā)展方向?qū)⒓杏谠贤卣埂⒕旮脑?、工藝?yōu)化、綜合利用。中國(guó)發(fā)酵工業(yè)的發(fā)展目標(biāo)是提升發(fā)酵工業(yè)整體技術(shù)水平，提高產(chǎn)品經(jīng)濟(jì)技術(shù)指標(biāo)，增強(qiáng)國(guó)際競(jìng)爭(zhēng)力，創(chuàng)造重大的社會(huì)和經(jīng)濟(jì)效益。